MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97 chromosome

Total Repeats: 7262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017307	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017307	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017307	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017307	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017307	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017307	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017307	A	6	6	7624	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017307	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017307	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017307	TA	4	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017307	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017307	ACG	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017307	TTC	2	6	8265	8270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017307	T	7	7	8287	8293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017307	TTA	2	6	8411	8416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017307	TGT	2	6	11661	11666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017307	TGC	2	6	12022	12027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017307	GTT	2	6	12092	12097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017307	GT	4	8	12098	12105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017307	AAC	2	6	12256	12261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017307	AGG	2	6	12302	12307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017307	TGT	2	6	12371	12376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017307	GAA	2	6	13215	13220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017307	GTT	2	6	13241	13246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017307	T	7	7	13264	13270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017307	GT	3	6	13330	13335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017307	GGT	2	6	13362	13367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017307	T	6	6	13379	13384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017307	GAC	2	6	13463	13468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017307	CAA	2	6	13491	13496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017307	CAT	2	6	13501	13506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017307	TTATC	2	10	14087	14096	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017307	AGG	2	6	14329	14334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017307	GAA	2	6	14368	14373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017307	ACC	2	6	14375	14380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017307	GGT	2	6	14395	14400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017307	CTT	2	6	14401	14406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017307	CAGTA	2	10	14634	14643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017307	GCA	3	9	15716	15724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017307	CCA	2	6	15747	15752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017307	GAT	2	6	15758	15763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017307	CGG	2	6	15773	15778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017307	A	6	6	17569	17574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017307	TAGCG	2	10	18333	18342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017307	GAA	2	6	20104	20109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017307	GAAA	2	8	20229	20236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017307	TGG	2	6	20285	20290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017307	GCT	2	6	20371	20376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017307	CGA	2	6	20410	20415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017307	A	6	6	20622	20627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017307	GAA	2	6	20887	20892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017307	AGT	2	6	20904	20909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017307	GAG	2	6	21074	21079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017307	GAT	2	6	21190	21195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017307	CGG	2	6	21231	21236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017307	AGCTTC	2	12	21341	21352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017307	CGA	2	6	21724	21729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017307	GTT	2	6	21731	21736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017307	TC	3	6	22470	22475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017307	TAT	2	6	22501	22506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017307	AGC	2	6	23579	23584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017307	T	6	6	23630	23635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017307	TCAT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017307	TGAT	2	8	23704	23711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017307	CT	3	6	23745	23750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017307	AT	3	6	23806	23811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017307	TTG	2	6	23946	23951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017307	A	6	6	23976	23981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017307	TAT	3	9	24000	24008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017307	AAT	2	6	24010	24015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017307	GCTA	2	8	28998	29005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017307	AG	3	6	29021	29026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017307	TAT	2	6	29044	29049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017307	TA	3	6	29404	29409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017307	GAG	2	6	37839	37844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017307	CCT	2	6	38879	38884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017307	TACT	2	8	38905	38912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017307	GCA	2	6	38941	38946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017307	TAG	2	6	38981	38986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017307	AAGA	2	8	38987	38994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017307	ATT	2	6	39200	39205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017307	CAC	2	6	39210	39215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017307	C	7	7	39289	39295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_017307	T	6	6	39367	39372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017307	TGCG	2	8	39437	39444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017307	CACAT	2	10	39456	39465	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017307	AATCC	2	10	39505	39514	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017307	TGT	2	6	40266	40271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017307	TTC	2	6	41237	41242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017307	ATA	2	6	41262	41267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017307	TA	3	6	41266	41271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017307	GCTG	2	8	41325	41332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017307	TGA	2	6	41394	41399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017307	GCC	2	6	41941	41946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017307	GCA	2	6	42039	42044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017307	GTA	2	6	42053	42058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017307	TG	3	6	42227	42232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017307	GC	3	6	42249	42254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017307	TCGG	2	8	42277	42284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017307	CAC	2	6	43288	43293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017307	GCG	2	6	43367	43372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017307	TGG	2	6	43490	43495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017307	AATG	2	8	43520	43527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017307	CG	3	6	43547	43552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017307	CCT	2	6	45113	45118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017307	ATT	2	6	45157	45162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017307	AAAT	2	8	45170	45177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017307	TGT	2	6	45221	45226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017307	TTGC	2	8	46899	46906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017307	AGC	2	6	46927	46932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017307	TTG	2	6	46943	46948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017307	GTT	2	6	46965	46970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017307	TTG	2	6	47053	47058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017307	AAT	2	6	47061	47066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017307	ACT	2	6	47432	47437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017307	TGG	2	6	47500	47505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017307	TAT	2	6	47514	47519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017307	AAG	2	6	47577	47582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017307	ACA	2	6	47675	47680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017307	TGA	2	6	47706	47711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017307	TTA	2	6	47750	47755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017307	TTG	2	6	47766	47771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017307	ATAC	2	8	47876	47883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017307	AAG	2	6	47884	47889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017307	GGC	2	6	47929	47934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017307	AGA	2	6	48056	48061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017307	ATG	2	6	48091	48096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017307	AGC	2	6	48145	48150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017307	TGC	2	6	48167	48172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017307	GCAT	2	8	48248	48255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017307	CAGTG	2	10	48297	48306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017307	AAG	2	6	48327	48332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017307	AGG	2	6	48382	48387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017307	TTC	2	6	48423	48428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017307	CCA	2	6	48473	48478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017307	GAA	2	6	48513	48518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017307	A	7	7	48591	48597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017307	GAG	2	6	48603	48608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017307	TGAGA	2	10	48639	48648	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017307	AGTGA	2	10	48689	48698	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017307	A	6	6	48792	48797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017307	AAG	2	6	48918	48923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017307	TGC	2	6	48961	48966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017307	TTC	2	6	49078	49083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017307	TCA	2	6	49093	49098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_017307	TGG	2	6	49904	49909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_017307	GAAT	2	8	117371	117378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017307	GGCA	2	8	117381	117388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
284	NC_017307	TAA	2	6	117389	117394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_017307	GTACC	2	10	155711	155720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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417	NC_017307	CCG	2	6	160728	160733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
418	NC_017307	ATAC	2	8	160736	160743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
419	NC_017307	CAGG	2	8	160756	160763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
420	NC_017307	CGG	2	6	160800	160805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_017307	GTT	2	6	160819	160824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_017307	CGA	2	6	160857	160862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_017307	A	6	6	160864	160869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_017307	GAG	2	6	164422	164427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_017307	T	6	6	171461	171466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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